به گزارش مشرق، در سال ۱۳۹۳ هجری قمری پس از وقوع زلزله‌ای شدید، سقف این مسجد فرو می ریزد. پس از فرو ریخته شدن، مرمت آن را میرزا مهدی قاضی طباطبایی برعهده می گیرد و یکی مهمترین دلیل قرار گرفتن مقبره شهید قاضی طباطبایی در این مسجد نیز همین موضوع مرمت مسجد توسط آن مرحوم است. سید محمدعلی قاضی طباطبایی (۱۲۹۳-۱۳۵۸ش) در دهم آبان 1358 توسط گروه فرقان ترور شد و اولین شهید محراب در جمهوری اسلامی ایران نام گرفت و مسجد مقبره به خاک سپرده شد.
مسجد مقبره واقع در داخل بازار تاریخی شهر تبریز در دوره صفوی تاسیس شده ، در این مسجد بسیار زیبا 9 ستون سنگی با ابعاد بزرگ و کاملاً زیبا جای داده شده است.