به گزارش مشرق، مجله رولینگ استون به نقل از مقام‌های امریکایی گفته که رفیع محمدی به فرستادن پول برای مسوول جلب و جذب داعش در کابل، حمایت از این گروه در فیسبوک و تلاش برای آزاد کردن یک عضو داعش از زندان، متهم است.
بر اساس این گزارش، محمدی در سال ۱۳۹۹ به عنوان مترجم نیروهای امریکایی استخدام شد. پلیس فدرال امریکا در سال ۱۴۰۱ پس از بررسی پیام‌های مسنجر، پست‌های فیسبوکی و شهادت یک نفر خبرچین از ارتباط محمدی با گروه داعش خراسان باخبر شد.
هرچند رفیع محمدی از اکتبر ۲۰۱۹ با امریکایی‌ها در افغانستان کار می‌کرد، اما او قبلاً با داعش ارتباط داشت.
ماموران امریکایی گفته‌اند که محمدی با مسوول جلب و جذب داعش که در ماه فوریه ۲۰۱۹ توسط امنیت ملی افغانستان دستگیر شد، در ارتباط بود.
در اعلامیه‌ای که از سوی امنیت ملی در آن زمان به نشر رسید، این اداره اعلام کرد که ابوعبیدالله متوکل، استاد دانشگاه و خطیب مسجد جامع شیخ محمدی‌ها را از ناحیه پنجم شهر کابل دستگیر کرده بود.
متوکل متهم بود که جوانان تحصیل‌کرده را از دانشگاه کابل استخدام و سپس به ننگرهار اعزام می‌کرد.
رفیع محمدی که ساکن امریکا بود، در سال ۲۰۱۸ مبلغ ۴۰۰ دلار از طریق ویسترن یونین برای ابوعبیدالله فرستاده بود.
رفیع محمدی با مبشر مسلمیار، استاد دیگری از دانشگاه کابل که در ماه جولای ۲۰۱۹ توسط امنیت ملی وقت به جرم جلب و جذب دانشجویان برای داعش دستگیر شد، نیز ارتباط داشت.
محمدی به ماموران گفته که او برای رهایی مبشر مسلمیار تلاش کرده بود.