گنبد كوچک بالاى مناره بر هشت ستون كوچک طلا كارى شده قرار دارد. اين ستونهاى متقابل چهار ايوان كوچک را تشكيل مى دهند. قاعده ى اين ستونها مساحتى مربع شكل بوده كه سقف اتاقک ساعت مى باشد.
درون اتاقک , دستگاه ساعت و دنده هاى آن قرار دارد. اين دستگاه ساخت كشور انگلستان بوده و در سال (1305هجرى) توسط يكى از وزراى ناصرالدين شاه قاجار بنام أمين الملك به حرم مطهر اهدا شد. دستگاه ساعت مستطيل شكل بوده و ارتفاع آن حدود دو متر مى باشد و به صورت افقى بر كف اتاقک قرار دارد. ميله اى عمودى بر روى اين دستگاه قرار دارد كه نيرو را از دستگاه به صفحه هاى چهارگانه ساعت منتقل مى كند. پاندولى بسيار بزرگ به ساعت متصل است و به طرف اتاقک دوم (پايين دستگاه) آويزان است. در اتاقک دوم, پلكان صعود به بالاى ساعت قرار دارد.
ارتفاع كلى مناره ى ساعت از كف پشت بام تا كلمه ى جلاله ى (الله) كه بالاى گنبد مناره قرار دارد (14,75متر) مى باشد. بدنه ى مناره (برج ساعت) از چوب ساخته شده است. طى پروژه ى ترميم مناره ى ساعت, بدنه ى آن بوسيله تير آهن استحكام يافت و ديواره هاى آن با كاشى معرق زيبايى پوشانده شد. كتيبه هاى نقش بسته بر ديواره هاى مناره ى ساعت كه از جنس كاشى معرق است به اين شرح است:
طرف شمالى: ( أشهد أن عليا حجة الله) و (علي مع القرآن و القرآن مع علي) و (يا عز من لا عز له)
طرف شرقى: ( أشهد أن عليا ولي الله) و (علي مع الحق و الحق مع علي) و (يا ذخر من لا ذخر له)
طرف غربى: (أشهد أن عليا ولي الله) و (علي مع الحق و الحق مع علي) و (يا ذخر من لا ذخر له)
طرف جنوبى ( أشهد أن عليا حجة الله) و (علي راية الايمان و منارة الهدى) و (يا غوث من لا غوث له)
ديواره هاى مناره ى ساعت در سال (1323هجرى) با صفحات فلزى طلاكارى شده پوشانده شد. بانى اين كار فردى نيكوكار از اهالى تبريز بود.