رهبرانقلاب به یکی از دعاهایی که آیت الله بهجت به آن سفارش می‌کرد، اشاره کردند و فرمودند: آیت الله بهجت از جمله کسانی بود که از جوانی مراقب نفس خود بود و به خواندن دعای «یا الله یا رحمن یا رحیم یا مقلب القلوب ثبّت قلبی علی دینک» تاکید داشت.