مالی پیش از پیوستن به شورای امنیت ملی، مدیر برنامه در بخش خاورمیانه و شمال آفریقای گروه بین‌المللی بحران، و دستیار سندی برگر،‌ مشاور وقت امنیت بود (1996-1998).

وی همچنین از سال 1994 تا 1996 به عنوان مدیر امور دموکراسی، حقوق بشر و بشردوستانه شورای امنیت ملی آمریکا فعالیت کرده است.

مالی به عنوان متخصص حوزه مناقشه اسرائیلی-فلسطینی شناخته شده و تألیفات متعددی در این حوزه دارد.

اوباما در سال 2015 وی را به عنوان مرد اصلی در حوزه خاورمیانه منصوب کرده و وی میز این منطقه را در شورای امنیت ملی در اختیار دارد.