کویر مرنجاب در شمال شهرستان آران و بیدگل در استان اصفهان واقع شده است و از شمال به دریاچه‌ی نمک آران و بیدگل، از شرق به کویر بند ریگ و پارک ملی کویر، از غرب به کویر مسیله و دریاچه‌های نمک حوض سلطان و حوض مره و در نهایت به شهرستان آران و بیدگل از سمت جنوب منتهی می‌شود. ارتفاع آن از سطح آب‌های آزاد، ۸۵۰ متر است. کویر مرنجاب از تپه‌های شنی زیادی تشکیل شده است و برخلاف آنچه که از کویر تصور می‌شود، پوشش گیاهی و جانوری بسیار غنی ای دارد.